גרניום פועל בעיקר דרך חוש הריח (המערכת הלימבית במוח האחראית על רגשות) ומצטיין באיזון וייצוב תנודות קיצוניות במצב הרוח כתוצאה מחוסר וודאות מתמשך. הוא מוריד רמות חרדה, מרגיע כעס או תסכול שנאגרו בגוף, ומשרה תחושת הגנה וביטחון. ברמה הפיזית, הוא מסייע באיזון המערכת ההורמונלית, שלעיתים קרובות יוצאת מאיזון בעקבות הפרשה מוגברת של הורמוני סטרס (קורטיזול ואדרנלין).